日本配偶簽申請 - 異國戀

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各位好,想請教一個有關申請日本配偶簽證的問題.

我跟我先生(日本人)遠距離戀愛三年多了,於今年
2月在日本跟台灣登記結婚.但是因為我目前手邊還
有工作關係,所以我入境日本辦完結婚登記後就回
來台灣,剩下的申請在留資格證明就交給我先生來
處理.我們雙方都以為回來台灣等在留資格證明比
免簽證入境90天會來得保險,也不用擔心90天後在
留資格審核還沒下來的問題.

但是,我後來上網查了一下,有不少說法是:如果申
請人雙方沒有同居的話,而且辦完結婚登記就離境
的話,被認定為假結婚的可能性很高.

我想請教對於申請日簽熟悉的版友,
1)辦完結婚登記後就離境,被認定為假結婚是真的嗎?
2)現在在留資格還在申請中,如果我就乾脆直接入境,
會影響我的在留資格申請嗎?
3)辦完結婚手續後離境,申請在留資格證明,大概會
需要多久時間?

謝謝各位...

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